长江航运科学研究所成立于1960年。为加快推进我国航运事业的发展，促进内河航运科技进步，在专业设置上特别强调结合水运交通行业特色，专门设有市场营销部、项目管理部、航运经济研究部、航运技术研究部、造船工艺研究部、船用产品研究部、船舶工程研究部、港口工程研究部、能源技术研究部、信息与自动化研究部等专业研究部门。主营业务包括:为水运行业用户提供船舶工程、内河船型的研究与开发、水上运输方式的研究论证、船舶性能与发动机测试、航运物流系统研究以及港口装卸工艺及设备、船用机电产品、航运信息与自动化工程、造船工艺及技术、航运经济与技术等科研设计项目的研究与开发，提供船用机电产品和港口装卸设备的交钥匙工程、船舶性能与船用节能技术产品的检测及节能技术服务等。
长航科研所现有职工142人，其中专业技术人员81人，享受国务院政府特殊津贴专家5名，教授级高级工程师5名，高级工程师31名，工程师29名。 在科研条件和设施方面,本所拥有交通部投资建设的160m×9.5m×3.4m室内船模试验水池和全套德国进口的W230发动机全自动检测系统、露天船模操纵试验水池、船舶能源利用检测试验中心、船舶主机遥控试验室、港口装卸机械及自动控制实验室、计算机辅助设计（CAD）中心，拥有日本进口的UCAM-8A大型动态应变仪、GPS卫星定位测试系统等各种科研仪器及设备200多台套，具有较强的研究开发实力和比较完备的科研试验手段。
改革开放以来,长航科研所共取得了130多项重大科技成果,获得国家和省部级科技进步奖30余项,有两项产品获国家知识产权局授予的发明专利。